Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RetnQ99P87 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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RetnQ99P87 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RetnQ99P87 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RetnQ99P87 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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