Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rab27bQ99P58 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rab27bQ99P58 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab27bQ99P58 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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