Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmfQ99NF2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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