Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms