Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkd1Q99MH6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkd1Q99MH6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms