Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms