Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms