Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcf19Q99KJ5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.5 ms