Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf144aQ925F3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms