Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms