Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf3Q922U1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms