Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncbQ91ZZ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms