Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms