Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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