Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhac1Q91Y10 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms