Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Setd3Q91WC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Setd3Q91WC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms