Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul7Q8VE73 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul7Q8VE73 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms