Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg2Q8VCK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms