Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh10Q8VCH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rdh10Q8VCH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rdh10Q8VCH7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rdh10Q8VCH7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh10Q8VCH7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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