Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc1Q8VCB1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndc1Q8VCB1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms