Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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