Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CipcQ8R0W1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms