Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssh3Q8K330 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms