Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrdQ8K2M3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrdQ8K2M3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms