Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms