Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbrd1Q8K0B2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms