Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SbsnQ8CIT9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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