Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh13Q8CEE7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh13Q8CEE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh13Q8CEE7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh13Q8CEE7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdh13Q8CEE7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms