Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms