Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc113Q8C5T8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc113Q8C5T8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc113Q8C5T8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc113Q8C5T8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc113Q8C5T8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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