Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh12Q8BYK4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms