Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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