Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp398Q8BV16 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms