Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops7bQ8BV13 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops7bQ8BV13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms