Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BPC6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BPC6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms