Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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