Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms