Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AW551984Q8BGF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms