Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms