Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms