Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnupnQ80W37 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms