Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup214Q80U93 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup214Q80U93 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms