Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo1Q7TT28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms