Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms