Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stk40Q7TNL3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms