Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mindy1Q76LS9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms