Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms