Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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