Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinlQ6ZQ12 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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