Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc44a1Q6X893 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms